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[1]尚敏,贺平安.基于网络间随机游走算法的lncRNA与疾病关系预测[J].浙江理工大学学报,2020,43-44(自科五):693-700.
　SHANG Min,HE Pingan.Prediction of the relationship between lncRNA and diseases  based on internetwork random walk algorithm[J].Journal of Zhejiang Sci-Tech University,2020,43-44(自科五):693-700.
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基于网络间随机游走算法的lncRNA与疾病关系预测()
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浙江理工大学学报[ISSN:1673-3851/CN:33-1338/TS]

卷:
第43-44卷
期数:
2020年自科五期
页码:
693-700
栏目:
出版日期:
2020-09-18

文章信息/Info

Title:
Prediction of the relationship between lncRNA and diseases  based on internetwork random walk algorithm
文章编号:
1673-3851 (2020) 05-0693-08
作者:
尚敏; 贺平安
浙江理工大学理学院，杭州 310018
Author(s):
SHANG Min;  HE Pingan
School of Science, Zhejiang Sci-Tech University, Hangzhou 310018, China
关键词:
疾病; 基因; 长链非编码RNA; 网络模型; 网络间随机游走; 相似性; 预测
分类号:
O29
文献标志码:
A
摘要:
通过构造疾病之间、lncRNA之间、基因之间的相似性网络模型，根据已有三者之间的相互关联数据，引入网络间随机游走算法预测潜在与疾病相关的lncRNA。将该算法应用到已有数据库中的lncRNA与疾病关联信息数据上，通过10倍交叉验证和AUC评估该算法。结果表明：与其他算法相比，该算法在10倍交叉验证下有更优的AUC值，显示该算法具有良好的预测性能。进一步应用该算法预测了与胃癌和结直肠癌相关的lncRNA，结果与已知的医学数据一致，表明该算法对于新疾病相关lnRNA的预测结果是有效的。

参考文献/References:

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备注/Memo

备注/Memo:
收稿日期：2020-01-30
网络出版日期：2020-05-08
基金项目：国家自然科学基金项目(61772027)
作者简介：尚敏(1994-)，女，湖北襄阳人，硕士研究生，主要从事生物信息学方面的研究
通信作者：贺平安，E-mail：pinganhe@zstu.edu.cn
更新日期/Last Update: 2020-09-15