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[1]叶德,杨支力,李东海,等.基于高通量测序半夏珠芽转录组研究[J].浙江理工大学学报,2017,37-38(自科2):282-288.
　YE De,YANG Zhili,LI Donghai,et al.Transcriptome Analysis of Pinellia Bulbil Based on Highthroughput Sequencing Technology[J].Journal of Zhejiang Sci-Tech University,2017,37-38(自科2):282-288.
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基于高通量测序半夏珠芽转录组研究()
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浙江理工大学学报[ISSN:1673-3851/CN:33-1338/TS]

卷:
第37-38卷
期数:
2017年自科2期
页码:
282-288
栏目:
出版日期:
2017-03-10

文章信息/Info

Title:
Transcriptome Analysis of Pinellia Bulbil Based on Highthroughput Sequencing Technology
文章编号:
1673-3851 (2017) 02-0282-07
作者:
叶德; 杨支力; 李东海; 徐涛
浙江理工大学生命科学院，杭州 310018
Author(s):
YE De;  YANG Zhili;  LI Donghai;  XU Tao
College of Life Science, Zhejiang Sci-Tech University, Hangzhou 310018, China
关键词:
半夏; 珠芽; 茎; 转录组; 激素
分类号:
Q946.2
文献标志码:
A
摘要:
利用高通量测序技术，对半夏珠芽和茎进行测序分析,共获得6.5 Gb原始数据，122 282 962条有效reads，平均长度为103.84 bp。经Denovo组装，获得90 175条unigenes，平均长度为751 bp。对长度分布、GC含量、表达水平等方面的评价显示，测序数据质量好且可信度高。将unigenes比对到NR、KOG和GO数据库，分别获得了55 197、46 237和31 622条注释信息。通过分析半夏珠芽和茎的基因表达量，共筛选出19个与玉米素、吲哚乙酸、茉莉酸、脱落酸和赤霉素代谢相关的差异表达基因。基因差异表达分析结果表明：玉米素、生长素、茉莉酸、脱落酸4种激素合成代谢相关基因在半夏珠芽中的表达水平高于茎中，而赤霉素则相反。

参考文献/References:

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备注/Memo

备注/Memo:
收稿日期： 2016-10-30
网络出版日期： 2017-01-19
基金项目： 国家自然科学基金项目（30772712）
作者简介： 叶德（1990-），男，浙江温州人，硕士研究生，主要从事分子生物学方面的研究
通信作者： 徐涛，E-mail: pkuxt@yahoo.com.cn
更新日期/Last Update: 2017-04-06