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[1]高永,杨支力,李东海,等.半夏凝集素结构预测分析[J].浙江理工大学学报,2015,33-34(自科2):269-275.
　GAO Yong,YANG Zhi li,LI Dong hai,et al.Prediction Analysis of  Pinellia Ternata Agglutinin  Structure[J].Journal of Zhejiang Sci-Tech University,2015,33-34(自科2):269-275.
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半夏凝集素结构预测分析()
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浙江理工大学学报[ISSN:1673-3851/CN:33-1338/TS]

卷:
第33-34卷
期数:
2015年自科2期
页码:
269-275
栏目:
(自科)生物与生命科学
出版日期:
2015-03-10

文章信息/Info

Title:
Prediction Analysis of  Pinellia Ternata Agglutinin  Structure
文章编号:
1673-3851 (2015) 02-0269-07
作者:
高永;  杨支力;  李东海;  徐涛
浙江理工大学生命科学学院, 杭州 310018
Author(s):
GAO Yong;  YANG Zhili;  LI Donghai;  XU Tao
School of Life Science, Zhejiang Sci-Tech University, Hangzhou 310018, China
关键词:
半夏凝集素;  结构;  同源建模;  甘露糖特异性结合
分类号:
Q51
文献标志码:
A
摘要:
为进一步深入了解半夏凝集素(Pinellia ternata agglutinin)已知蛋白序列的性质,采用生物信息学预测方法,对其结构进行了系统性分析。从NCBI数据库中调取半夏凝集素蛋白序列信息,利用 Expasy、SMART、CBS、SWISSMODEL、 DNAman6.0等生物软件对凝集素蛋白的一级结构、高级结构性质进行全面分析。半夏凝集素的基本结构信息表明其属于稳定的亲水性蛋白,人工神经网络法预测其二级结构含有16个α螺旋,91个β折叠和150个随机卷曲,同源建模分析显示半夏凝集素蛋白序列与模板岩芋凝集素蛋白A链和B链的同源相似度分别达76.15%和84.55%。高级结构信息显示半夏凝集素N端存在跨膜区域和信号肽区域,并且整个蛋白序列中存在多个N糖基化位点和蛋白激酶磷酸化位点,功能域预测表明半夏凝集素含有两个B型凝集素功能域,每个功能域均含有保守的甘露糖结合位点,并且这些结合位点多位于半夏凝集素蛋白空间构象的外部。通过对半夏凝集素结构性质的预测为进一步实验验证其生物功能和药用机理提供了有益参考。

参考文献/References:

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备注/Memo

备注/Memo:
收稿日期： 2014-07-28
基金项目： 国家自然科学基金项目(30772712)
作者简介： 高永(1986-),男,安徽阜阳人,硕士研究生,主要从事分子遗传学与天然产物化学方面的研究
通信作者： 徐涛,E-mail:xutao1998cn@163.com
更新日期/Last Update: 2015-03-24